역대 정부의 조직개편은 주로 출범 당시 국가적 현안을 해결하는 데 초점을 두고 이뤄졌다. 국민들에게 국정철학을 빠르게 전달하는 방편으로 부처를 통폐합하거나 조직을 신설하는 등 조직개편을 적극 활용한 것이다.
2017년 3월 박근혜 전 대통령 탄핵 이후 두 달 만에 탄생한 문재인정부는 국정 공백을 최소화하는 데 중점을 뒀다. 예전 정부처럼 대통령직인수위원회를 운영하기 힘들었던 만큼 선거기간부터 조직개편의 밑그림을 그려놓고 발 빠르게 움직였다. 조직개편의 큰 줄기는 국정 개입을 방지하고, 중소기업 지원 등 공정과 혁신의 경제 모델을 구축하는 데 방점이 찍혔다.
아울러 세월호 참사와 같은 대형 재난에 효과적으로 대응하기 위한 체계를 만드는 것도 주요 과제였다. 이에 따라 대통령비서실 권한이 축소됐고, 장관급 기관이었던 대통령경호실은 차관급인 대통령경호처로 개편됐다. 또 중소벤처기업부를 신설하고, 미래창조과학부가 과학기술정보통신부로 이름을 바꿨다. 행정자치부와 국민안전처를 통합해 행정안전부를 설치하며 국가 재난관리 체계도 새롭게 만들었다.
박근혜정부는 ‘작은정부’를 강조하며 부처 간 통합에 나섰던 이명박정부와 달리 행정기관별 고유 기능과 전문성을 높이는 데 집중했다. 과학·정보통신기술과 연관된 ‘창조경제’의 컨트롤 타워로 미래창조과학부를 만들고, 외교통상부와 기획재정부의 통상교섭 관련 기능을 산업통상자원부로 이관하는 동시에 경제부총리도 신설했다. 세월호 참사는 안전 관련 조직을 새롭게 정비하는 계기가 됐다. 국무총리 소속으로 국민안전처가 신설됐고, 구조 실패 책임을 물어 해양경찰청을 해체했다.
이명박정부의 조직개편은 부처 간 통폐합이 키워드였다. 유사·중복 기능을 가진 부처를 통합하며 예전 대비 11개 기관이 감축됐다. 대표적으로 대통령비서실과 경호실을 대통령실로, 기획예산처와 재정경제부가 기획재정부로 통합됐다. 과학기술부와 교육인적자원부는 교육과학기술부로 합쳐졌다. 임기 중반에는 보건복지가족부의 청소년, 가족 기능이 여성부로 이관돼 부처 명칭이 각각 보건복지부, 여성가족부로 개편됐다.